Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms