Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms