Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms