Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms