Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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