Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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