Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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