Protein–RNA interactions for Protein: A2ALK8

Ptpn3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn3A2ALK8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn3A2ALK8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ptpn3A2ALK8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ptpn3A2ALK8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ptpn3A2ALK8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ptpn3A2ALK8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms