Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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