Protein–RNA interactions for Protein: A2A5R2

Arfgef2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef2A2A5R2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arfgef2A2A5R2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arfgef2A2A5R2 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arfgef2A2A5R2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arfgef2A2A5R2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Arfgef2A2A5R2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Arfgef2A2A5R2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Arfgef2A2A5R2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Arfgef2A2A5R2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Arfgef2A2A5R2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Arfgef2A2A5R2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Arfgef2A2A5R2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Arfgef2A2A5R2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Arfgef2A2A5R2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Arfgef2A2A5R2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arfgef2A2A5R2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms