Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm27029A2A4P4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms