Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms