Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms