Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms