Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn7Q9Z261 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn7Q9Z261 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn7Q9Z261 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn7Q9Z261 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn7Q9Z261 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn7Q9Z261 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn7Q9Z261 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn7Q9Z261 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn7Q9Z261 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn7Q9Z261 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn7Q9Z261 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn7Q9Z261 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn7Q9Z261 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn7Q9Z261 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn7Q9Z261 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn7Q9Z261 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms