Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms