Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx39bQ9Z1N5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms