Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms