Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5Q9Z131 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms