Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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