Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Trpc2Q9R244 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Trpc2Q9R244 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Trpc2Q9R244 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Trpc2Q9R244 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Trpc2Q9R244 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Trpc2Q9R244 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Trpc2Q9R244 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Trpc2Q9R244 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Trpc2Q9R244 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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