Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TapbpQ9R233 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TapbpQ9R233 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TapbpQ9R233 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TapbpQ9R233 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TapbpQ9R233 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TapbpQ9R233 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TapbpQ9R233 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TapbpQ9R233 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TapbpQ9R233 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TapbpQ9R233 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TapbpQ9R233 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TapbpQ9R233 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TapbpQ9R233 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TapbpQ9R233 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TapbpQ9R233 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TapbpQ9R233 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TapbpQ9R233 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TapbpQ9R233 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TapbpQ9R233 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TapbpQ9R233 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TapbpQ9R233 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TapbpQ9R233 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TapbpQ9R233 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms