Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms