Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms