Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms