Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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