Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms