Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkp3Q9QY23 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms