Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk1nQ9QXV0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms