Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms