Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms