Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdc42ep4Q9JM96 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdc42ep4Q9JM96 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms