Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Rabgef1Q9JM13 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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