Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsmQ9JL96 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms