Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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