Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms