Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3glb1Q9JK48 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3glb1Q9JK48 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3glb1Q9JK48 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3glb1Q9JK48 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3glb1Q9JK48 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3glb1Q9JK48 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3glb1Q9JK48 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sh3glb1Q9JK48 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3glb1Q9JK48 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3glb1Q9JK48 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3glb1Q9JK48 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3glb1Q9JK48 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3glb1Q9JK48 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3glb1Q9JK48 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3glb1Q9JK48 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3glb1Q9JK48 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3glb1Q9JK48 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sh3glb1Q9JK48 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3glb1Q9JK48 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3glb1Q9JK48 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3glb1Q9JK48 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3glb1Q9JK48 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sh3glb1Q9JK48 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3glb1Q9JK48 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3glb1Q9JK48 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3glb1Q9JK48 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3glb1Q9JK48 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3glb1Q9JK48 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3glb1Q9JK48 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3glb1Q9JK48 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3glb1Q9JK48 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3glb1Q9JK48 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3glb1Q9JK48 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sh3glb1Q9JK48 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sh3glb1Q9JK48 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3glb1Q9JK48 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3glb1Q9JK48 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3glb1Q9JK48 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3glb1Q9JK48 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3glb1Q9JK48 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3glb1Q9JK48 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sh3glb1Q9JK48 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3glb1Q9JK48 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3glb1Q9JK48 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3glb1Q9JK48 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3glb1Q9JK48 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3glb1Q9JK48 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sh3glb1Q9JK48 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sh3glb1Q9JK48 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3glb1Q9JK48 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sh3glb1Q9JK48 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sh3glb1Q9JK48 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3glb1Q9JK48 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sh3glb1Q9JK48 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3glb1Q9JK48 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3glb1Q9JK48 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sh3glb1Q9JK48 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3glb1Q9JK48 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3glb1Q9JK48 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3glb1Q9JK48 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3glb1Q9JK48 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3glb1Q9JK48 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3glb1Q9JK48 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3glb1Q9JK48 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3glb1Q9JK48 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3glb1Q9JK48 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3glb1Q9JK48 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3glb1Q9JK48 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3glb1Q9JK48 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3glb1Q9JK48 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3glb1Q9JK48 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3glb1Q9JK48 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3glb1Q9JK48 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3glb1Q9JK48 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3glb1Q9JK48 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3glb1Q9JK48 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3glb1Q9JK48 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3glb1Q9JK48 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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