Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms