Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms