Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ccdc86Q9JJ89 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ccdc86Q9JJ89 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ccdc86Q9JJ89 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ccdc86Q9JJ89 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ccdc86Q9JJ89 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ccdc86Q9JJ89 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ccdc86Q9JJ89 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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