Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms