Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms