Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tm9sf3Q9ET30 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tm9sf3Q9ET30 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tm9sf3Q9ET30 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tm9sf3Q9ET30 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tm9sf3Q9ET30 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tm9sf3Q9ET30 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tm9sf3Q9ET30 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms