Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms