Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms