Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms