Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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