Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Rab11fip1Q9D620 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Rab11fip1Q9D620 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Rab11fip1Q9D620 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Rab11fip1Q9D620 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Rab11fip1Q9D620 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab11fip1Q9D620 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab11fip1Q9D620 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab11fip1Q9D620 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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