Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W6

Slco6d1, MCG6225, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco6d1Q9D5W6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco6d1Q9D5W6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco6d1Q9D5W6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco6d1Q9D5W6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco6d1Q9D5W6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco6d1Q9D5W6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco6d1Q9D5W6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco6d1Q9D5W6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco6d1Q9D5W6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco6d1Q9D5W6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco6d1Q9D5W6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco6d1Q9D5W6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco6d1Q9D5W6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco6d1Q9D5W6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco6d1Q9D5W6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco6d1Q9D5W6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco6d1Q9D5W6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco6d1Q9D5W6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco6d1Q9D5W6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco6d1Q9D5W6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco6d1Q9D5W6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco6d1Q9D5W6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco6d1Q9D5W6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco6d1Q9D5W6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco6d1Q9D5W6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco6d1Q9D5W6 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco6d1Q9D5W6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco6d1Q9D5W6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco6d1Q9D5W6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco6d1Q9D5W6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco6d1Q9D5W6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco6d1Q9D5W6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco6d1Q9D5W6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco6d1Q9D5W6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco6d1Q9D5W6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco6d1Q9D5W6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms