Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms